(1)物理因素
在怀孕12周内，X线对胚胎有很强的致畸作用。孕妇在应用放射性碘治疗时，放射线会经胎盘到达胎体，破坏胎儿甲状腺功能，引起胎儿甲状腺功能低下或产生无脑儿。
(2)化学因素
一些化学物质污染了环境，对孕妇和胎儿都会产生很大影响。铅、砷、苯、农药等金属及化学物质，也可以通过胎盘影响胎儿发育，或引起流产、早产和死胎。
(3)病原体感染
在怀孕早期感染病毒引起的疾病，如风疹、感和肝炎等可导致胎儿畸形。此外，巨细胞病毒、疱疹病毒，以及脊髓灰质炎、腮腺炎、麻疹、水痘等感染，也可能引起胎儿畸形。改善环境，防止胎儿畸形。
2.具体的预防措施
(1)
补充叶酸
根据中国出生缺陷监测网2011年的数据，中国出生的每800个婴儿中，大约有1个出现神经管畸形。如在怀孕头3个月内缺乏
叶酸，可导致胎儿神经管发 育缺陷，从而增加裂脑儿，无脑儿的发生率。其次，孕妇经常补充
叶酸，可防止新生儿体重过轻、早产、脊膜膨出、脊柱裂以及婴儿腭裂(兔唇)等先天性畸形。
(1)提高环境质量
搞好污水、污气、污物的处理，绿化、美化环境，避免化学物质污染周围环境而影响孕妇健康或危及胎儿。当然这不是某一个人能做到的，需要全社会的努力。
(2)孕妇做好自我保健
孕妇怀孕时，要尽量少到公共场所去，尽量杜绝各种被感染的机会。特别是怀孕早期更要注意个人卫生和环境卫生，居室尽量保持良好的通风和采光，注意冷暖适宜，加强锻炼，积极预防感冒，保证孕期身体健康。在怀孕头3个月内甚至更长一段时间内，应禁止x线照射。一般认为，即使是常规的肺部透视，也要推迟到妊娠7个月时方可进行。
现在提倡一对夫妇只生1个孩子，因此要选择最有利于优生的环境与时机，也就是说要有计划地受孕。注意避免一些不利因素，就能避免或减少有缺陷的婴儿出生。
